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多序列比对CLUSTAL W中两序列比对的并行

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多序列比对是一种重要的生物信息学工具,在生物的进化分析以及蛋白质的结构预测方面有着积极的意义.以clustalw为代表的渐进式多序列比对算法在这个领域取得了很大的成功,成为应用最为广泛的多序列比对程序.但是当比对数目比较多的时候,时间仍然比较长,本文设计一种的clustalw并行算法,给出计算实例,并分析了比对效率和加速比.

尹智刚、王希诚、谷俊锋

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大连理工大学软件学院,大连,116023

大连理工大学工业结构分析国家重点实验室,大连,116023

生物信息学 多序列比对 clustalw

中国计算机学会

第16届全国计算机新科技与教育研讨会

2005-07-28

乌鲁木齐

全国计算机新科技与计算机教育论文集

66-72

2005