本文利用美国康乃尔大学构建的含C(Capsaicinoidsynthetase)基因的中间克隆载体pBIAT3通过序列测定和比对获得C基因的编码序列,该序列包含一个1323bp完整开放阅读框和182bp的3'末端,共编码一个由441个氨基酸组成的蛋白质,其核苷酸序列与拟南芥已酰基转移酶的相似性有87.6﹪.通过特异引物CS-F/CS-R对不同品种甜椒和辣椒基因组DNA进行PCR扩增,甜椒和辣椒共有一条约1700bp的片段,辣椒比甜椒多一条约1400bp的片段.短片段测序比对分析显示,甜椒C基因在5'端689bp的缺失导致辣味消失.牛角型甜椒0538扩增的对应片段序列在第40位G替代为A,该变异使第14位疏水性天冬氨酸变为亲水性天冬酰胺可能是造成信号肽失去功能,不能完成辣椒素的合成过程使辣味缺失.长片段被认为是与Capsicumannuum中乙酰基转移酶有关的catf2基因,与C基因的核苷酸序列有87.3﹪的相似性,氨基酸序列有88.9﹪的相似性,且有一670bp的内含子.
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