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6株O型口蹄疫病毒VP1及3A基因克隆与序列分析

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本研究设计合成了针对VP1和3A基因特异性引物,利用RT-PCR方法扩增获得6个口蹄疫病毒分离株完整VP1和3A基因,测序结果分析表明,6个分离株的VP1基因全长639bp,编码213个氨基酸,与国内外发表的O型毒株VP1基因核苷酸序列同源性为73.6％～98％,所推导的氨基酸序列同源性为79.8％～98.1％;3A基因核苷酸同源性为67.5％～97.4％,推导的氨基酸序列同源性为66.7％～95.4％.5个分离毒(O/ShH02/01、O/ShH02/02、O/ShH02/03、O/ShH02/04、O/SD03/01)的VP1和3A基因都与O/SKR/2002和O/UKG/35/2001同源性最高,属于ME-SA拓扑型中的PanAsia(泛亚株);而O/AH03/01的VP1和3A基因则与O/HKN/2002和O/Taiwan/97的同源性最高,属于O型口蹄疫病毒的Cathay拓扑型,并且与O/HKN/2002和O/Taiwan/97相同3A基因在93～102位均存在缺失现象.对此6株分离病毒的VP1基因序列测定和分析,丰富了我国FMDV毒株VP1基因资料库,3A基因测序和分析,则为我国FMDV流行趋势及宿主异嗜性变化方向提供理论依据.

杨晓伟、姜平、杜以军、李玉峰、段舒怡

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南京农业大学农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室,江苏,南京,210095

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