从北京鸭cDNA文库中克隆了鸭MHC class I基因(Anpl-MHC I),并对其等位基因多态性、基因组结构、以及多肽结合区(PBD)的氨基酸置换率和三级结构进行了量化分析.Anpl-MHC I长1,068个核苷酸,编码356个氨基酸;基因组DNA由8个外显子和7个内含子组成.Anpl-MHC I等位基因可分为4个类型(-UA~-UD).在其α1和α2区有28个高置换位点,并存在重组杂合现象.Anpl-MHC I氨基酸序列中保留了HLA-A2与抗原多肽结合的8个关键性氨基酸;相互间同源率为83.6﹪~88.5﹪,与鸡(B21,B2,Y)同源率为57.3﹪~64.6﹪;与人和鼠的同源率为40.3﹪~42.8﹪,即Anpl-MHC I比鱼类、蛙、鸡更接近于人类MHC class I序列.RT-PCR检测到Anpl-MHC I在脑、心、肾、脾、肠和法氏囊中表达.与人HLA-A2晶体结构比较,Anpl-MHC I在4个区有缺失或插入变异,其α螺旋和β折叠区相对保守.MHC class I分子系统树也进一步揭示了鸭与鸡,与鱼类、两栖类、哺乳动物以及人类的进化关系.
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