为评价rep-PCR在快速鉴定啤酒污染菌中的应用,首先比较了DNA提取方法,确定CTAB法作为制备rep-PCR的DNA模板的方法.并通过PCR产物直接测序的方法,从分离菌中鉴定得到11种常见的啤酒污染菌.用BOXA1R和(GTG)5引物扩增标准菌,采用GelComparⅡ软件处理电泳图,构建污染菌的标准指纹图库.经过聚类分析表明,BOXA1R和(GTG)5对L.brevis、L.buchneri、L.casei/paracasei、L.plantarum和L.fermentum的聚类效果具有互补性,并首次提出指纹比对快速鉴定的相似性阈值的概念.对来自三个不同来源的9株乳酸菌的快速鉴定结果表明,rep-PCR鉴定技术简单、快速、可靠,在快速鉴定方面将具有重要的应用价值.