HIV-1整合酶二聚体与硫氮硫扎平抑制剂相互作用

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中文摘要：目的:研究HIV-1整合酶 (IN) 与已知抑制剂硫氮硫扎平类的结合模式、结合强度,为寻找具有更好活性的抗HIV药物提供帮助.方法:用同源模建方法搭建每条单链核心区具有两个Mg2+的IN二聚体模型.分子对接搜索能量较低的硫氮硫扎平类化合物-IN对接复合物,并对复合物进行了分子动力学模拟.结果:得到了每条单链核心区具有两个Mg2+的IN二聚体模型.得到了能量较低的多个硫氮硫扎平类化合物-IN对接复合物.发现这些构象具有很强的相似性,硫氮硫扎平类化合物具有很强的结合专一性.对于构象的研究发现,氮硫扎平类化合物与IN活性位点的一些氨基酸有极重要的相互作用.结论:建立的模型能够有效地反映HIV-1 IN与硫氮硫扎平类抑制剂的作用特点和作用模式.为进一步的分子改造、分子设计提供分子水平的帮助.

作者：

王丽东、北京工业大学生命科学与生物工程学院、王存新

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作者单位：

重庆工商大学药物化学与化学生物学研究中心,重庆,400067

北京,100022

北京工业大学生命科学与生物工程学院,北京,100022

关键词：

分子模拟 HIV1整合酶硫氮硫扎平类抑制剂金属离子分子动力学

主办单位：

中国药学会

会议名称：

2006第六届中国药学会学术年会

会议时间：

2006-11-09

会议地点：

广州

会议母体文献：

2006第六届中国药学会学术年会论文集

出版时间：

2006