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丹参乙烯应答因子结合蛋白基因的克隆分析

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目的:获得丹参乙烯应答因子结合蛋白基因序列,并进行生物信息学分析和初步的表达特性研究。方法:利用cDNA芯片技术,从不同时期毛状根中获得目的基因。利用BLAST进行序列比对,ORF finder寻找开放读码框,Prosite分析蛋白质的基本结构域。用半定量RT-PCR检测其在丹参组培苗根、茎、叶中的表达情况。 结果:得到一个乙烯应答因子结合蛋白基因全长序列,全长952bp,具有一个699bp的开放读码框和87bp的5'非编码区、166bp的3'非编码区,推测的氨基酸序列中含有一个高度保守的AP2/ERF DNA结合域。半定量RT-PCR表明,EREBP基因在丹参组培苗根、茎、叶中均有转录水平的表达,根中表达量高于茎和叶中的。 结论:首次得到丹参乙烯应答因子结合蛋白基因。为其功能研究提供了基础。

崔光红、袁媛、黄璐琦、毛莹、付桂芳

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中国中医科学院中药研究所,北京 100700

丹参 乙烯应答因子 结合蛋白 基因克隆 生物信息学 基因序列

中华中医药学会

中国中西医结合学会

2007年中华中医药学会第八届中药鉴定学术研讨会暨中国中西医结合学会中药专业委员会全国中药学术研讨会

2007-08-01

长沙

2007年中华中医药学会第八届中药鉴定学术研讨会暨中国中西医结合学会中药专业委员会全国中药学术研讨会论文集

297-299

2007