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猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
猪源新城疫病毒SP13株的F基因克隆及序列分析
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中文摘要:
本试验采用RT-PCR方法对猪源新城疫病毒(NDV)SP13株的F基因进行了扩增与克隆,并测定出F基因的核苷酸全序列,推导出氨基酸序列。F基因全长为1662bp,单一的开放阅读框,编码553个氨基酸的长肽,裂解位点的氨基酸序列为112G-R-Q-G-R-LL117,与弱毒株在这一区域的序列(112G-R/K-Q-G/S-R-L117)相符,F蛋白有6个潜在的糖基化位点和13个Cys残基位点,其疏水构型有3个强疏水区。通过同源率、系统发育、致病性、疏水性和抗原性等比较分析。结果表明SP13与LaSota、Clone 30不但同源性达到99.9%,而且在致病性、疏水性和抗原性等方面也极为相似。
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关键词:
猪源
新城疫病毒
F基因
克隆
序列分析
系统发育分析
主办单位:
中国畜牧兽医学会
会议名称:
第二届全国人畜共患病学术研讨会
会议时间:
2008-11-22
会议地点:
江苏泰州
会议母体文献:
第二届全国人畜共患病学术研讨会论文集
页码:
147-151
出版时间:
2008