疾病相关SNP数据的分类组织及数据库构建

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中文摘要：疾病和SNP(single nucleotide polymorphism SNP)的相关性已引起人们越来越多的关注。吴健雄实验室构建了一个疾病相关SNP位点分析系统，研究疾病和SNP位点的相关性。目前研究SNP的主要方法是生物芯片技术。然而人类的所有群体中有千万个SNP位点，用高投入长时间的生物芯片技术对每个位点进行实验，是不现实的。鉴于此，需要从人的千万个SNP位点中筛选出与特定疾病密切相关的SNP位点，指导生物芯片实验的设计。同时，研究与特定疾病相关的SNP位点的芯片设计中的主要问题是挑出所感兴趣的一个基因或一组基因，然后根据这些基因挑选出可能的与疾病密切相关的SNP位点，进行实验验证。鉴于此，为方便实验人员的芯片设计工作，我们建立了DrSNP(Disease-relate SNP)数据库，把SNP位点按照基因、基因功能结构区域进行组织并实现筛选功能。

作者：

张青青、王琦、赵媛媛、吴建盛、陆祖宏、孙啸

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作者单位：

东南大学生物电子学国家重点实验室，南京 210096

关键词：

DrSNP数据库 SNP位点生物芯片芯片设计

主办单位：

中国科学院

会议名称：

2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会

会议时间：

2006-11-12

会议地点：

合肥

会议母体文献：

2006年中国科学院智能计算与生物信息学学术研讨会论文集

页码：

143-146

出版时间：

2006