应用MedlineR挖掘基因间关系的尝试

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中文摘要：数据挖掘技术逐渐成熟，广泛应用于医学领域，包括基础医学和临床医学应用各方面，已经成为一种必然趋势。本文即将介绍一种基于Medline的可视化数据挖掘工具-MedlineR，用于发现基因之间的关联。该程序的主要原理是依据共词分析的原理来寻找与某特定基因有生物学关系的其他基因，两两统计一组基因、基因一关键词对在同一篇文献中出现的次数，并以此为基础对这些基因、关键词建立共词矩阵，最后以Pajek可识别形式输出，利用Pajek的做图功能得到一个以单个基因为网络节点，与其有关联的基因作为邻近节点的网络拓扑结构，节点间的连线粗细代表相邻两种基因共引的文献数量，从而反映出基因之间、基因与关键词之问关联的紧密程度。

作者：

杨颖、崔雷

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作者单位：

中国医科大学图书馆 110001

中国医科大学医学信息学系 110001

关键词：

MedlineR 数据挖掘基因网络拓扑结构共词矩阵

主办单位：

中华医学会医学信息学分会

会议名称：

中华医学会第十四次全国医学信息学术会议

会议时间：

2008-10-01

会议地点：

太原

会议母体文献：

中华医学会第十四次全国医学信息学术会议论文集

页码：

1-3

出版时间：

2008