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猪ACACA基因编码蛋白结构和功能的生物信息学分析

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本文对脂肪合成关键酶乙酰辅酶A羧化酶-α基因所编码蛋白进行生物信息学分析.查找猪ACACA基因的ORF框,之后对其编码蛋白的二级结构、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位及结构功能域进行预测分析.结果表明,猪ACACA基因CDS区全长7041 bp,其编码蛋白含2346个氨基酸.二级结构以α螺旋与无规卷曲为主.该蛋白N端无信号肽,为非分泌蛋白;不含跨膜结构区,预测其为膜外区蛋白;亚细胞定位结果显示该蛋白为非细胞器蛋白,是胞质蛋白的可能性最大;功能域分析发现该蛋白序列含有BC结构域、CT结构域、CPSase大亚基N端结构域、ATP-grasp折叠结构域、生物素基/硫辛酰基结合域等结构域.以上研究结果将为进一步研究猪ACACA基因与脂肪合成的关系提供基础资料.

陶隽、贾青、魏星灿、胡慧艳、邢增喜

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河北农业大学动物科技学院,保定071001

国家北方山区农业工程技术研究中心,保定071001

基因序列 蛋白结构 生物信息学

中国畜牧兽医学会

中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会

2013-08-01

山西太谷

中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会论文集

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