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核小体定位机制及在胚胎发育中的核小体重排

张勇

核小体定位机制及在胚胎发育中的核小体重排

张勇1
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作者信息

  • 1. 同济大学生命科学与技术学院,生物信息学系,上海200092
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摘要

核小体是染色质的基本结构单元,核小体定位,也就是核小体相对于DNA序列的位置,可以影响转录因子与DNA的结合,从而有效地调控基因的转录.对核小体定位机制的研究已经成为表观遗传领域的一个研究热点;国际上有学者基于核小体对DNA序列的偏好性提出"核小体密码"的观点,认为核小体的定位主要是由DNA序列信息所决定的.前期的工作通过将体外组装的核小体定位信息与细胞内的核小体定位信息进行比较,系统的评估了DNA序列对核小体定位的影响.通过对高通量数据的比较发现,细胞内与体外组装的核小体定位之间存在实质性区别:首先,细胞内核小体在基因转录起始位点周围存在规律性的周期排布,而体外组装的核小体定位缺乏这一特征;其次,细胞内核小体之间的连接区长度大致相等,而体外组装的核小体缺乏规律;此外,细胞内核小体定位信号的稳定性要显著高于体外组装的核小体.这个工作针对"核小体密码"的观点提出了相反的证据,表明DNA序列本身对于核小体定位影响较小;而转录和转录因子结合等调控事件会对其具有较大影响。

关键词

核小体/定位机制/胚胎发育/基因重排

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主办单位

中国遗传学会

会议名称

中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会

会议时间

2013-09-01

会议地点

哈尔滨

会议母体文献

中国遗传学会第九次全国会员代表大会暨学术研讨会论文集

页码

403

出版时间

2013
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