MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约为22nt的内源性短链非编码RNA,广泛参与了功能基因的转录后调控.内脏和皮下脂肪是哺乳动物体内主要的两种脂肪组织,它们在解剖、生理、代谢和临床危害性上都有明显的差异.前人对脂肪组织的研究主要集中在DNA甲基化、mRNA和蛋白水平,然而对于两种脂肪组织miRNA表达谱的比较目前任属空白.在本研究中,利用高通量测序技术对猪不同部位6种脂肪组织的miRNA转录组进行了全面综合的对比,共鉴定出219个已知和124个哺乳动物间保守的miRNA,以及97个新的miRNA*.对比发现,miR-148a-3p、-143-3p、-27b-3p、-let-7a-1-5p、和-let-7f-5p这五个miRNA在6种脂肪组织中均呈现极高的表达丰度,该结果暗示了这类miRNA可能是与脂质生成高度相关的"管家miRNA".层次聚类结果表明,6种脂肪组织可能通过miRNA表达谱很好地分为内脏脂肪和皮下脂肪两类,同时miR-17-92簇和miR-181家族这类炎症和免疫反应相关miRNA在大网膜中的高度富集也暗示了大网膜沉积的潜在代谢风险.差异表达和靶基因预测分析结果显示,内脏脂肪组织富集的miRNA主要参与调控脂肪酸代谢和能量平衡,而内脏脂肪富集的miRNA主要参与调节炎症反应相关通路.
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