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割手密过氧化氢酶基因(SsCAT-1)的克隆与比较分析

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割手密是栽培种甘蔗最重要的近缘物种之一,具有较强的抗逆性.本文以高粱过氧化氢酶基因(NCBI登录号为XM002437586.1)cDNA序列为探针,对甘蔗EST数据库进行同源检索、筛选和拼接,后经基因组PCR、分子克隆、序列分析验证成功分离了2个割手密过氧化氢酶基因cDNA序列(SsCAT-1c和SsCAT-1d,GeneBank登录号为KF864229和KF864230).2条序列全长均为1532bp,包含10bp的5’非翻译区(UTR)和43bp的3’UTR,以及一个1479bp的开放读码框,编码492个氨基酸,此蛋白序列具有过氧化氢酶保守结构域,属于CAT家族.这2条序列之间相似性为99.2％,存在12个单核苷酸多态性(SNP)位点,蛋白相似性99.0％,存在5个氨基酸变异位点.将推测的SsCAT-1c和SsCAT-1d蛋白序列与高粱、水稻、玉米等物种进行同源进化分析,均表现出极高的保守性.从而为进一步通过生物技术改良甘蔗品种抗逆性提供理论依据。

刘洋、姚艳丽、胡小文、徐磊、邢淑莲、张树珍

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中国热带农业科学院湛江实验站/热带旱作农业研究中心,湛江,524000

中国热带农业科学院热带生物技术研究所/甘蔗研究中心,海口,571101

割手密 过氧化氢酶基因 克隆技术 序列分析

中国作物学会甘蔗专业委员会

中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会

2014-08-01

海口

中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集

47-54

2014