基因组序列分析揭示我国存在甘蔗黄叶病毒新基因型

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中文摘要：本文测定了来自我国广东的一个甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)分离物chn1的近全长基因组序列.分析表明,所获得的序列长度(5803bp)覆盖了该病毒全基因组序列的98％以上,包含全部的6个开放阅读框和它们之间的非编码区.该分离物同古巴分离物CUB-YL1(CB86010)在病毒基因组ORF0,ORF1,ORF2序列上的同源性最高,但两者间核苷酸同一率(95.2％-97.4％)和推导氨基酸同一率(93.2％-97.2％)均低于已知各基因型之间的同一率.通过序列比对和构建系统进化树分析,结果均表明chn1代表了该病毒内的一个新基因型,建议将该新基因型命名为CHN1.

作者：

M.-Q. Wang、王明强、G.-H. Zhou、周国辉

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作者单位：

College of Natural Resources and Environment,South China Agricultural University,Guangzhou,Guangdong 510642,China

华南农业大学资源环境学院植物病毒研究室,广东广州 510642

关键词：

甘蔗黄叶病毒基因型近全长基因组序列分析

主办单位：

中国作物学会甘蔗专业委员会

会议名称：

中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会

会议时间：

2014-08-01

会议地点：

海口

会议母体文献：

中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集

页码：

149-154

出版时间：

2014