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基于高分辨率熔解曲线的桃SNP基因分型

鲁振华 牛良 朱运钦 崔国朝 曾文芳 潘磊 王志强

基于高分辨率熔解曲线的桃SNP基因分型

鲁振华 1牛良 1朱运钦 1崔国朝 1曾文芳 1潘磊 1王志强1
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作者信息

  • 1. 中国农业科学院郑州果树研究所/国家桃葡萄品种改良中心/农业部果树育种技术重点实验室,郑州 450009
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摘要

作物中,SNP标记具有分布广泛、分辨率高、共显性和多态性高等特点.桃全基因组测序的完成,获得了大量的SNPs.简单、快速的SNP基因分型是开展后续研究的基础,因此,本研究拟建立采用高分辨率熔解曲线进行不同SNP的基因分型方法.以半矮生性状杂交后代的分离群体为研究材料,在定位目标基因的区间内开发连锁和不同类型的SNP标记的基础上,采用高分辨率熔解曲线进行SNP的基因分型.明确了DNA模板和Mg2+是影响基因分型的关键因子;HRM分析可对由单个核苷酸变异引起的4种不同的SNP进行基因分型,并正确区分了半矮生型和普通生长型.建立了基于HRM的SNP基因分型,该体系可用于桃的基因定位、遗传多样性和品种鉴定等研究中.

关键词

桃树/全基因序列测定/单核苷酸多态性/基因分型/高分辨率熔解曲线

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主办单位

中国园艺学会

会议名称

中国园艺学会桃分会第五届全国桃学术年会

会议时间

2015-07-22

会议地点

宁波

会议母体文献

中国园艺学会桃分会第五届全国桃学术年会论文集

页码

211-214

出版时间

2015
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