中国经济发展逐步进入新常态,创新驱动已成为未来经济增长的核心动力,区域自主创新能力也已成为区域间竞争的焦点.本文在参考前人研究的基础上,从区域自主创新的投入能力、环境支撑能力和产出能力三个维度入手,建立了一套能够衡量区域自主创新能力的指标体系,以2009-2014年间全国30个省、自治区和直辖市的区域数据为基础,运用熵值法对各区域自主创新能力进行实证研究,并从创新人才、外部资金支持、创新主体地位和自主创新成果等角度对东部、中部和西部的区域自主创新能力发展趋势进行了评价和差异比较,并提出相关政策建议.