本研究利用SSR标记对100个广州木棉单株进行木棉遗传多样性分析,目的是研究广州地区木棉在遗传多样性水平上的差异和分化情况.结果表明,从99对木棉SSR标记种筛选出11对具有多态性的引物,共检测出37个多态性位点,每对引物的等位变异为2~6个,平均为3.23个;木棉群体的Ne变化范围为1.0~3.1591,平均值为1.8954,居群间的Shannon信息指数(I)为0.6868,Nei's基因多样性指数(He)为0.4175.根据UPGMA分析,基于遗传距离0.416处将100份材料分为5大类群,结果表明,广州木棉亲缘关系与采集地和表型无显著相关性.