竹亚科Ty3-Gypsy转座子的克隆、鉴定及系统进化分析

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中文摘要：本研究根据Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的保守序列设计简并性引物,从毛竹、绿竹、菲白竹、龟甲竹中扩增出了430bp左右的目标片段.目的条带经克隆、回收、测序及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了160条Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶序列.这些核苷酸序列具有一定的异质性,长度变化范围为366～438bp,同源性范围为65.4％～84.5％.翻译成氨基酸后,将其氨基酸序列与不同物种Ty3-gypsy反转录转座子反转录酶的氨基酸序列进行聚类分析,可将其序列归属于植物Ty3-gypsy反转录转座子六大亚群中的Del亚群,亚群又可分为Del1、Del2、Del3、Del4和Del55个家族.此外,系统进化分析结果表明在某些家族中,来源于不同种或变种的转座子比来源于同一种的转座子的亲缘关系近,而来源同一种的转座子的转座子反而比来源不同种或变种的转座子亲缘关系远,表明在进化历史上这几个物种间的反转录转座子可能存在横向传递的现象.

作者：

杨艳红、汤定钦、周明兵

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作者单位：

浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安 311300

关键词：

竹亚科 Ty3-Gypsy转座子反转录酶氨基酸序列系统进化

主办单位：

中国林学会

会议名称：

第十一届中国竹业学术大会

会议时间：

2015-10-21

会议地点：

湖南桃江

会议母体文献：

第十一届中国竹业学术大会论文集

页码：

96-104

出版时间：

2015