竹亚科En/Spm类转座子的克隆、鉴定及系统进化分析

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中文摘要：本研究根据竹亚科En/Spm转座酶保守区域设计一对简并性引物,从毛竹、梨竹、孝顺竹、龟甲竹中扩增出了650bp左右的目标片段.目的条带经克隆、回收、测序等试验过程及相关生物信息学软件进行序列分析后,获得了206条En/Spm转座子DNA转座酶序列.这些核氨酸序列的长度变化范围为195～226bp,同源性变化范围为52.9％～100％.将这些核苷酸序列翻译成氨基酸序列后,将其与不同物种En/Spm类转座子转座酶的氨基酸序列进行比对及聚类分析并构建进化树,可将其序列分类为Ba_Enspm1、Ba_Enspm2、Ba_Enspm3、Ba_Enspm4、Ba_Enspm5一共5大类.除此之外,系统进化分析结果显示En/Spm类转座子虽起源相同,但在竹亚科不同竹种中却产生了分化,具体表现为来源于同一竹种的亲缘关系近且近乎集中分布.

作者：

潘飞翔、汤定钦、周明兵

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作者单位：

浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安 311300

关键词：

竹亚科 En/Spm类转座子转座酶氨基酸序列系统进化

主办单位：

中国林学会

会议名称：

第十一届中国竹业学术大会

会议时间：

2015-10-21

会议地点：

湖南桃江

会议母体文献：

第十一届中国竹业学术大会论文集

页码：

105-111

出版时间：

2015