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玉米ZmFKF1基因的克隆与生物信息学分析

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ZmFKF1是光周期调控开花途径中一个重要的蓝光受体,为了研究ZmFKF1基因的结构与功能,本研究采用同源克隆的方法从玉米自交系CML288中克隆到一个ZmFKF1基因.结果表明,ZmFKF1基因的cDNA全长2291bp,编码618个氨基酸.生物信息学表明FKF1蛋白的相对分子质量为68.12kD,理论等电点为5.72,总平均亲水性为-0.26,是一种亲水性蛋白.ZmFKF1蛋白质的二级结构中含有26.7%的a-螺旋(alpha helix)、54.05%的无规则卷曲(random coil)、19.26%的延伸链(Extended strand).ZmFKF1蛋白不含有信号肽;也不含有跨膜结构域,说明ZmFKF1属于非分泌蛋白.亚细胞定位结果显示该蛋白位于细胞核内;其蛋白质序列中含有一个PAS结构域、F-box-like结构域、4个KELCH重复结构域,与拟南芥AtFKF1结构域相似.进化树的分析结果表明:ZmFKF1与水稻OsFKF1的亲缘关系最近,其次是小麦.

Yifeng Jing、景艺峰、Shujing Zhao、赵淑靓、Qingqing Liu、刘青青、Cuiling Wang、王翠玲

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河南科技大学 农学院,河南 洛阳 461023

玉米 ZmFKF1基因 基因克隆 生物信息学

河南省遗传学会

河南省遗传学会2017年学术年会

2017-12-01

郑州

河南省遗传学会2017年学术年会论文集

152-157

2017