摘要
KORRIGAN(KOR)基因是内切-1,4-β-葡聚糖酶基因家族重要的成员之一,其编码的KOR蛋白可以降解纤维素葡聚糖之间的β-1,4-糖苷键,是植物细胞生长过程中纤维素生物合成的关键调控酶之一,对于纤维素的生物合成起着重要的调控作用.为了了解KOR基因在桉树木材形成过程中的功能,本研究从构建的大花序桉(Eucalyptus cloeziana)幼苗转录组数据库中获得了1条KOR基因的部分序列,并利用RACE和RT-PCR技术获得KOR基因的全长cDNA,命名为EC-KOR基因.利用荧光定量PCR方法对EC-KOR基因在未成熟木质部、韧皮部、幼叶、成熟叶及茎尖的表达特性进行分析,结果表明,该基因在未成熟的木质部表达量最高,韧皮部的表达量次之,其余几个部位的表达量都很低.通过生物信息学分析发现,EC-KOR基因的gDNA长度为2696bp,含有4个内含子和5个外显子;全长cDNA为2418bp,含有1869bp的开放阅读框,编码623个aa.经比对分析,大花序桉KOR蛋白的氨基酸序列与其他植物的KOR蛋白具有较高的相似性,并且具有KOR蛋白特有的保守序列和相关特征,因此推测这条KOR基因对桉树的生长发育具有一定的调控作用.
NETL