鸡matrin 3基因的克隆及生物信息学分析

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中文摘要：matrin3蛋白是核基质的重要组成部分,构成了细胞核内以非组蛋白为主的不溶性纤维网络.研究表明matrin3主要定位在细胞核,是一种多功能蛋白,如参与NMDA诱导的神经元死亡、参与DNA双链断裂的修复、调节逆转录病毒基因组的转录、作为RNA剪接复合物组分参与RNA剪接等.本研究对鸡matrin3蛋白基因进行克隆和生物信息学分析,旨在为后续研究鸡matrin3蛋白在相关家禽病毒复制和致病性中的作用奠定基础.2材料与方法根据GenBank中公布的鸡matrin3基因序列(登陆号:NM_204147),利用Primer Premier5.0设计扩增鸡matrin3基因ORF的特异性引物.以提取DF-1细胞总RNA的反转录产物为模板进行RT-PCR扩增鸡matrin3基因,胶回收PCR产物克隆至载体pMD19-T载体,将菌液PCR和酶切鉴定均正确的重组质粒送Invitrogen公司序列.运用生物信息学软件ProtParam、SOPMA和TMHMM等进行蛋白质理化性质、二级结构和跨膜结构域等预测和分析;应用MegAlign和MEGA5.0等软件进行核苷酸同源性分析和绘制遗传进化树.

作者：

邓珊珊、段志强、嵇辛勤、阮涌、赵佳福、胡焱、万彪

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作者单位：

州大学动物科学学院,贵州贵阳550025

贵州大学动物科学学院,贵州贵阳550025

贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳550025

关键词：

鸡 matrin3基因基因克隆生物信息学

主办单位：

中国畜牧兽医学会

会议名称：

中国畜牧兽医学会家禽学分会第十八次全国家禽学术讨论会

会议时间：

2017-08-04

会议地点：

昆明

会议母体文献：

中国畜牧兽医学会家禽学分会第十八次全国家禽学术讨论会论文集

页码：

192

出版时间：

2017