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绵羊miR-299a-3p的靶基因预测及生物信息学分析
乔利英 1马元 1梁琛 1刘文忠1
作者信息
- 1. 山西农业大学动物科技学院,山西太谷030801
- 折叠
摘要
目的：研究MiRNA在绵羊脂质代谢过程中的调节作用,揭示其分子机制. 方法：本试验利用miRanda,TargetScan和DIANA-microT等3个靶基因在线预测软件,预测绵羊miR-299a-3p的靶基因,并结合KEGG上的脂质代谢相关通路分析预测miR-299a-3p的潜在靶基因及其功能. 结果：miR-299a-3p有24个潜在的靶基因,这些基因富集到了脂肪代谢PPAR通路、MAPK信号通路、蛋白质水解的过程和VEGF癌症相关通路.miR-299a-3p在小鼠、人类、绵羊以及大鼠中序列高度保守. 结论：miR-299a-3p的24个潜在调控的靶基因中,UCP2基因经分析是miR-299a-3p的最适靶基因,并且对于脂肪代谢有调控的作用.
关键词
绵羊/脂质代谢/非编码单链RNA-299a-3p/靶基因预测/分子机制引用本文复制引用
主办单位
中国畜牧兽医学会会议名称
中国畜牧兽医学会信息技术分会第十二届学术研讨会会议时间
2017-08-01会议地点
河南鹤壁会议母体文献
中国畜牧兽医学会信息技术分会第十二届学术研讨会论文集页码
226-230出版时间
2017