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新型鸭呼肠孤病毒DRV-XX株全基因组序列测定及分析

李文锋 梁国智 卿柯香 梅敏敏 黄雯晶 李晓文 黄淑坚

新型鸭呼肠孤病毒DRV-XX株全基因组序列测定及分析

李文锋 1梁国智 1卿柯香 1梅敏敏 1黄雯晶 1李晓文 1黄淑坚1
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作者信息

  • 1. 佛山科学技术学院生命科学学院,广东 佛山528231
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摘要

本研究自广东省新兴地区疑似新型鸭呼肠孤病料样品中分离出一株病毒,命名为DRV-XX株.利用RT-PCR方法对DRV-XX株进行全基因组序列扩增,拼接获得其全基因组(23419bp),对其10个基因节段进行分析显示,该分离株与禽呼肠孤病毒(ARV)及番鸭呼肠孤病毒(MDRV)的相似性较低,而与国内NDRV相似性较高(99%),表明该分离株为NDRV.对其10个RNA节段分别进行测序及遗传进化分析,其中S3基因序列分析显示,DRV-XX与MDRV共同构成一主干支,与其S1、S2、S4、M1、M3、L1基因的一致;而M2基因进化树显示,DRV-XX与ARV处于同一主干支;由L2、L3组基因分析显示,DRV-XX与ARV在同一主干支,并有MDRV参与其中,而另一主干支为MDRV.因此,推测DRV-XX株的不同基因组节段来源不同,可能是ARV和MDRV发生同义突变,也可能是基因重组的结果.该研究丰富了NDRV的基因库相关信息,也为广东地区NDRV的防制提供一定参考依据.

关键词

鸭呼肠孤病毒/全基因组/序列测定/遗传进化

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主办单位

广东省畜牧兽医学会

会议名称

第27届广东畜牧兽医科技大会

会议时间

2018-06-01

会议地点

广州

会议母体文献

第27届广东畜牧兽医科技大会论文集

页码

329-332

出版时间

2018
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