目的：研究广东地区常见SPF级小鼠和大鼠的肠道菌群多样性. 方法：分别采集3家广东地区实验动物生产单位的C57BL/6、ICR、BALB/c小鼠和Wistar、SD大鼠的盲肠内容物样品,采用Illumina miseq高通量测序方法对肠道菌群进行检测,再使用生物信息学方法对样品进行微生物群落分析、Alpha多样性分析、Beta多样性分析. 结果：稀释性曲线说明本次测序的数据量合理;小鼠、大鼠肠道菌群共分成八个门,其中拟杆菌门、厚壁菌门占据主要地位,从属水平看最多的是拟杆菌属,其次Hungatella、副杆状菌属、乳酸杆菌属等;样品间差异性分析显示相同设施来源动物的菌群组成相似性较高,来源于相同设施的同一品系动物之间也存在一定相似性;Alpha分析结果显示来源于DJ、SY的动物物种丰富度差不多;Beta分析说明相同来源动物的肠道菌群差异较小,品系也对肠道菌群差异性有所影响. 结论：来源是动物肠道菌群多样性的主要影响因素,品系对肠道菌群多样性也有一定影响.
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