摘要
目的:在中国新育成品种-苏山猪群体中,鉴别影响初生体尺和乳头数性状的基因位点及候选基因. 方法:本文利用猪Affymetrix Porcine SNP55K Array基因分型芯片检测了269头苏山猪,并利用获得的38,128有效SNPs基因分型数据开展全基因组关联分析. 结果:共发现1个位于X染色体上,基因组水平显著影响乳头数的SNP(P=1.31E-6)和15个染色体水平显著影响初生体尺和乳头数性状的SNP.最显著的SNP的单个有利等位基因可增加0.74总乳头数,解释了约20％的表型变异.上述位点有5个SNP位于先前报道的数量性状位点(QTL)中,7个SNP存在一因多效现象.有趣的是,显著SNP的位置候选基因中,有12个基因在功能上与初生体尺和乳头数目性状有关,如SPRED2、MKX、TMSB4X和ESR1. 结论:本研究结果揭示了苏山猪群体中影响初生体尺和乳头数性状的遗传基础,为苏山猪及含苏山猪血缘群体的初生体尺和乳头数性状的遗传改良提供了分子标记.
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