摘要
为了解新型鸭呼肠孤病毒(NDRV)感染对雏鸭肠道菌群的影响,以3日龄雏番鸭为试验动物,经腿肌注射NDRV-NP03强毒株,攻毒后5天无菌采集肝和盲肠内容物,利用16S rRNA高通量测序和生物信息学分析肠道菌群的变化.结果表明:雏番鸭的肠道菌群主要由厚壁菌门、变形菌门和拟杆菌门组成;LEfSe多级物种差异判别分析发现两组间共有29个型存在显著差异,NDRV攻毒后导致肠道菌群中的益生微生物如Ruminococcaceae和Lachnospirace的相对丰度明显降低,而Enterobacteriaceae,Escherichia_Shigella 和Streptococcus的相对丰度明显增高.因此,NDRV 强毒株感染雏鸭可导致肠道中的益生菌减少,而有害菌增多,引起菌群失衡,进而引起雏鸭拉稀.