艾纳香MYB转录因子家族生物信息学分析

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中文摘要：MYB是植物中庞大的转录因子家族之一,在植物体内有着广泛的生物学功能.基于艾纳香全长转录组数据库,利用DNAMAN6.0、MEGA5.05软件以及Protparam、Weblogo和SOPMA在线网站分析艾纳香MYB转录因子家族蛋白的分类,理化性质,氨基酸序列高级结构,保守结构域,系统进化等.结果表明,挖掘到127个MYB基因,预测47条具有MYB转录因子保守结构域的蛋白序列;根据结构域可分为1R-BbMYB、R2R3-MYB两个亚类,其中R2-BbMYB与R3-BbMYB基序中都含有3个保守的色氨酸,而R1-BbMYB基序只有2个保守的色氨酸;艾纳香MYB家族蛋白均为亲水性蛋白,热稳定性较高且富含碱性性氨基酸,大部分蛋白以无规则卷曲为主,其中R2R3-BbMYB3、R2R3-BbMYB4与1R-BbMYB15蛋白是以α-螺旋为主;与拟南芥MYB家族共同构建的进化树发现,艾纳香MYB家族在进化上包括2个大类,6个亚类,通过艾纳香与拟南芥MYB蛋白序列相邻或是进化关系近可以预测艾纳香MYB基因功能,为进一步对艾纳香MYB家族基因研究及其功能鉴定提供科学依据.

作者：

GUAN Lingliang、官玲亮、ZHA Ying、查英、BAI Lin、白琳、YU Fulai、于福来、陈振夏、CHEN Zhenxia、陈小鹭、CHEN Xiaolu、XIE Xiaoli、谢小丽、王凯、WANG Kai、黄梅、HUANG Mei

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作者单位：

中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,海南省艾纳香工程技术研究中心,海南海口571101

黑龙江八一农垦大学,黑龙江大庆163319

关键词：

艾纳香 MYB转录因子生物信息学功能鉴定

主办单位：

中国热带作物学会

云南省热带作物学会

会议名称：

中国热带作物学会南药专业委员会2019年学术年会暨南药、黎药产业发展研讨会

会议时间：

2019-08-14

会议地点：

海口

会议母体文献：

中国热带作物学会南药专业委员会2019年学术年会暨南药、黎药产业发展研讨会论文集

页码：

40-50

出版时间：

2019