澳洲坚果实时定量PCR分析中内参基因的筛选

扫码查看

原文链接

NETL

中文摘要：澳洲坚果是重要的热区经济作物,目前国内外尚无关于澳洲坚果实时定量PCR 分析的内参基因的报道.选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR 分析准确性的先决条件.为筛选澳洲坚果实时定量PCR 最适内参基因,本文以澳洲坚果的根、茎、叶、果皮、果仁为材料,利用实时荧光定量PCR 技术,对18S rRNA,Actin,CYP,EF1a,EF1b,GAPDH,MDH,TUBa,TUBb,UBQ,UBC 等11个常用的内参基因在澳洲坚果不同组织中的表达稳定性进行了分析;geNorm 软件分析的M值从小到大依次为:EF1b= MDH＜ GAPDH＜ UBC＜ Actin＜18S＜CYP＜ EF1a＜ TUBb＜ UBQ ＜ TUBa.M 值越小越稳定,最适内参数目为2,最稳定内参组合为EF1b 和MDH;NormFinder 软件分析稳定性依次为GAPDH＜CYP＜EF1a＜18S＜MDH＜ EF1b＜TUBb＜Actin＜ UBC＜ UBQ＜TUBa,GAPDH 稳定性最好; BestKeeper 分析稳定性:MDH＜EF1b＜GAPDH＜18S＜CYP＜UBC＜Actin＜EF1a＜TUBb＜UBQ 认为MDH 最稳定,EF1b 次之.综合分析表明,MDH 和EF1b 基因可以作为澳洲坚果实时定量PCR 分析的校正内参基因,在澳洲坚果的基因表达调控相关研究中具有重要意义.

作者：

Qian Yang、杨倩、Ziping Yang、杨子平、Yali Zhou、周娅丽、Dongquan Chen、陈东泉、Heng Liu、刘恒

展开 >

作者单位：

中国热带农业科学院南亚热带作物研究所

农业部热带果树生物学重点实验室

国家热带果树种质资源圃,广东湛江 524091

关键词：

澳洲坚果内参基因实时荧光定量PCR技术稳定性分析

主办单位：

中国热带作物学会

会议名称：

2019年全国热带作物学术年会

会议时间：

2019-09-01

会议地点：

西安

会议母体文献：

2019年全国热带作物学术年会论文集

页码：

72-79

出版时间：

2019