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在非生物胁迫下毛竹活性LTR反转录转座子的捕获和鉴定

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毛竹(Phyllostachys edulis)是中国栽培悠久、面积最广、经济价值最高的竹种.毛竹全基因组序列分析表明LTR(long terminal repeat)反转录转座子在毛竹基因组含量最丰富,是竹子基因表达调控网络重要组成部分.但是对于LTR反转录转座子在毛竹生长发育和对抗胁迫上的作用机制还不清楚.因此本实验通过LTR反转录转座子的染色体外线性DNA扩增法(amplification of LTR of eclDNAs followed by sequencing,ALE-seq),在全基因的水平上对LTR反转录转座子在毛竹胁迫处理过程中的转座情况以及对基因表达的影响进行了研究.

陈娅欣、周明兵

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浙江农林大学 省部共建亚热带森林培育国家重点实验室,杭州 311300

毛竹 LTR反转录转座子 基因表达 调控机制 非生物胁迫

中国林学会

第十五届中国竹业学术大会

2019-11-01

福州

第十五届中国竹业学术大会论文集

88-89

2019