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花叶矢竹PjELIP基因克隆及生物信息学分析

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植物早期光诱导蛋白(ELIPS)基因最早被发现于豌豆黄化幼苗转绿的过程中,且在叶绿体结构发育完全后不久消失.为了探索花叶矢竹叶色变异机理,本研究克隆了花叶矢竹PjELIP基因cDNA全长,预测其编码的蛋白结构和功能,分析其在叶色变异过程中的表达特性.经分析,PjELIP基因CDS区序列长度为561bp,编码183个氨基酸;相对分子质量为18711.60,理论等电点为9.59.PjELIP蛋白的水溶液在280nm处的消光系数为13980,不稳定系数为39.99,是一种稳定类蛋白质;亲水性为0.218,是一种疏水性蛋白.功能域中有一个捕光复合体结构域,磷酸化位点可能只有3个.蛋白质二级结构中α螺旋的有近45.9%,34.97%为无规则结构,三级结构大部分由α螺旋和无规则结构构成.PjELIP基因与毛竹的同源性高达92.9%,与其他禾本科植物如大麦亲缘关系较近,但与玉米关系较远.研究发现,在花叶矢竹复绿过程中,PjELIP基因的表达量逐渐上升,且明显超过正常绿叶对照组,这可能与叶绿体光形态建成有关,叶绿体的增多使得PjELIP基因表达量升高.

Yanghui ZHAO、赵杨辉、Keyi CHEN、陈柯伊、Youzhi CAO、曹友志、Haiyun YANG、杨海芸

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浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地,浙江临安 311300

花叶矢竹 PjELIP基因 基因克隆 生物信息学

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