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基于GWAS定位血浆中锰相关基因及对其胃腺癌影响

YANG Shuang-feng 杨双凤 WU Chuan-cheng 吴传城 JI Shu-mi 季淑眯 JIANG Yu 姜雨 SHU Zhi-xiong 舒智雄 LIU Bao-ying 刘宝英

基于GWAS定位血浆中锰相关基因及对其胃腺癌影响

YANG Shuang-feng 1杨双凤 1WU Chuan-cheng 1吴传城 1JI Shu-mi 1季淑眯 1JIANG Yu 姜雨 SHU Zhi-xiong 舒智雄 LIU Bao-ying 刘宝英
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作者信息

  • 1. 福建医科大学公共卫生学院,福建福州350122
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摘要

目的:基于全基因组学定位血浆锰元素相关基因,并探究定位基因对胃腺癌发生发展的影响. 方法:采用1∶1病例对照研究的方法.使用ICP-MS测量96例胃腺癌患者与96例健康人的血浆中锰元素浓度,与其所对应的全基因SNP进行QTL分析,筛选出相关基因位点,并将其分为纯胃腺癌组、纯对照组、交集组.然后进行生信富集分析,利用DAVID在线软件评分出相应基因所参与的具有统计学意义的信号通路.将以上相应基因通过STRING在线软件,分析基因编码蛋白过程中的交互网络,筛选出交互作用较强的节点基因. 结果:1.胃腺癌组与对照组血浆锰浓度存在统计学差异(P<0.05),且胃腺癌组锰浓度低于对照组.2.发现SLIT3、UNC5C、DPP10等锰元素相关基因SNP与胃癌相关.3锰元素相关基因在对照组和胃腺癌组中的作用模式存在差异. 结论:1.本实验胃腺癌组中血浆锰浓度低于对照组,提示锰元素可能参与胃癌的发生、发展过程,但具体机制尚未明确,有待进一步的研究.2.锰相关基因SNP与胃癌的发生、发展关系密切.3.对照组与胃腺癌组的差异基因分子作用模式存在差别.

关键词

胃腺癌/锰元素/基因定位/全基因组学

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主办单位

上海市预防医学会/《环境与职业医学》/青岛大学

会议名称

第十五届全国环境与职业医学研究生学术研讨会

会议时间

2019-11-07

会议地点

青岛

会议母体文献

第十五届全国环境与职业医学研究生学术研讨会论文集

页码

432-436

出版时间

2019
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