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太行菊MYB转录因子OtMYB44基因的克隆及表达分析

BA Ting-ting 巴亭亭 杨宁 YANG Ning LIU Yu 刘昱 WANG Shi-cai 王士才 YANG Yong-juan 杨永娟 GUO Yan-hong 郭彦宏 钟剑 ZHONG Jian SUN Ming 孙明

太行菊MYB转录因子OtMYB44基因的克隆及表达分析

BA Ting-ting 1巴亭亭 2杨宁 2YANG Ning 2LIU Yu 1刘昱 1WANG Shi-cai 1王士才 1YANG Yong-juan 杨永娟 GUO Yan-hong 郭彦宏 钟剑 ZHONG Jian SUN Ming 孙明
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作者信息

  • 1. 花卉种质创新与分子育种北京市重点实验室,国家花卉工程技术研究中心,城乡生态环境北京实验室,园林环境教育部工程研究中心,林木花卉遗传育种教育部重点实验室,园林学院,北京林业大学,北京 100083
  • 2. 济南市国有苗圃,济南 250100
  • 折叠

摘要

MYB转录因子是植物中最大的一类,在植物的生长发育及各种逆境胁迫中发挥非常重要的作用.本研究以太行菊的根系为研究材料,运用RT-PCR技术克隆得到太行菊的MYB基因完整的ORF序列,命名为OtMYB44,并对其进行了生物信息学分析.分析表明,OtMYB44基因ORF全长1020bp,编码339个氨基酸.预测其蛋白分子量36991.14Da,等电点为9.23,属于不稳定亲水性蛋白.不含有信号肽和跨膜结构,预测蛋白定位于细胞核内.OtMYB44与黄花蒿(PWA75916.1)亲缘关系较近,同源性达94.41%.二级结构预测表明,OtMYB44蛋白由93个α-螺旋(27.43%)、14个β-转角(4.13%)和198个无规则卷曲(58.41%)组成,与三级结构预测基本相符.qRT-PCR分析表明,20%PEG6000处理后,太行菊根中OtMYB44的表达量在0-24h呈现先降低后升高的模式,研究结果为进一步研究太行菊MYB转录因子对干旱等逆境的响应机制奠定基础.

关键词

太行菊/MYB转录因子/OtMYB44基因/基因克隆/基因表达

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主办单位

中国园艺学会

会议名称

2020年中国观赏园艺学术研讨会

会议时间

2020-12-01

会议地点

海口

会议母体文献

2020年中国观赏园艺学术研讨会论文集

页码

366-373

出版时间

2020
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