摘要
以3种不同遮荫棚型下西洋参根际土壤细菌为研究对象,了解不同棚型对西洋参根际细菌的影响.应用Illumina MiSeq高通量测序技术测定土壤细菌的16S rRNA V3-V4变异区序列,分析土壤细菌菌群的组成.结果显示:在97％的相似水平下共得到OTU个数为130,957个,涵盖了34门、111纲、324目、574科、1033属、1578种的细菌.高拱棚下土壤细菌群落的丰富度和多样性指数均高于平棚和传统棚.3种不同遮荫棚型下西洋参根际土壤样品中的优势菌门主要有变形菌门(Proteobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)等;优势菌属主要有慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)、硝氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、芽单胞菌属(Gemmatimonas)、Candidatus_solibacter、嗜盐粘细菌(Haliangium)等,利用分类等级树对3种棚型下的土壤细菌群落从门到属所有分类单元的等级关系进行了分析得到在各等级中高拱棚的OTUS丰度均最高.PCA分析表明3种棚型下的细菌群落差异大.对菌群代谢功能进行预测,发现高拱棚菌群特有功能要明显多于平棚和传统棚.本研究分析了不同遮荫棚型对西洋参根际土壤细菌的多样性、结构和功能的影响,对西洋参遮荫棚的优化升级提供了理论指导.
NETL