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橙色红曲菌聚酮合酶基因的克隆

魏康霞

橙色红曲菌聚酮合酶基因的克隆

魏康霞1
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作者信息

  • 1. 南昌大学
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摘要

真菌聚酮类化合物是一类庞大的次级代谢产物,具有结构和功能的多样性,它包括洛伐他汀、色素和各类真菌毒素等。聚酮合酶(PKS)是介导聚酮化合物合成的关键酶。本论文以橙色红曲菌AS3.4384为出发菌株,从中克隆PKS基因,为后期的功能鉴定及PKS基因全长的克隆奠定基础。具体的研究内容和结果如下: 1.根据已知的真菌PKS基因之序列,设计了2对简并引物(pksF1/R1和pksF1/R2);以橙色红曲菌AS3.4384基因组DNA为模板,PCR 扩增获得了4条PKS基因片段,分别命名为pksl(Contigl)、pks2(Contig2)、pks3(Contig3)和pks10(Contig10)。经Blast比对发现,pks2与NCBI中已公布的紫色红曲菌PKSl序列(AJ414729,7144bp)完全同源。 2.根据pks1、pks3和pks10的序列,设计了3对特异性的引物(PF1/PR1、PF3/PR3和PF10/PR10);用3对特异引物从橙色红曲菌AS3.4384 Fosmid文库中进行PCR筛选,获得了3个阳性黏粒;采用超声波破碎阳性黏粒,并将其克隆至pUC18载体中,分别构建了3个2~4Kb的亚克隆文库;以PF1/PR1、PF3/PR3和PF10/PR10为引物,分别从对应的亚克隆文库中筛选阳性克隆子,获得了3条PKS基因,即MApksl、MApks3和MApks10。 3.经生物信息学分析,MApks1为非还原Ⅲ型PKS基因,其编码的蛋白可能参与桔霉素的合成;MApks3和MApks10为还原型PKS基因,其翻译蛋白与负责催化合成T-毒素、洛伐他汀的聚酮合酶均有同源性。

关键词

聚酮合酶/橙色红曲菌/简并引物/基因克隆

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授予学位

硕士

学科专业

微生物学

导师

许杨

学位年度

2007

学位授予单位

南昌大学

语种

中文

中图分类号

Q93
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