应用ISSR标记技术对来自云南、四川、广西、贵州和海南5个省区的32个麻疯树种源的遗传多样性和亲缘关系进行分析，比较不同地理种源麻疯树的遗传差异，为麻疯树的良种选育以及种质资源保护提供实验依据。研究结果如下： 1．设计了4种改良CTAB法和1种改良SDS法，用于从麻疯树嫩叶中提取DNA。通过比较实验，从5种改良方法中，筛选并建立了适合于麻疯树DNA提取的改良CTAB法Ⅲ。用该法提取的麻疯树DNA质量完全能满足ISSR分析的要求。 2．通过对影响ISSR-PCR．扩增的模板DNA、dNTP、引物、Taq DNA聚合酶以及Mg2+浓度等5因素(不同水平)的优化实验，建立了适合于麻风树ISSR-PCR扩增的体系：模板DNA 300ng/25μL、dNTP 0.15 mmol/L、引物0.20 μmol/L、Taq DNA聚合酶1.0U/25μL及Mg2+3.0 mmol/L，反应体积25 μL；与之相适应的扩增程序为：94℃预变性3min；94℃变性1min，55℃退火1.5min，72℃延伸1.5min，循环46次；最后在72℃延伸5min。 3．从96个ISSR引物中筛选得到21个引物，用于32个麻疯树种源的ISSR分析。21个引物共检测到。210条扩增条带，其中多态性条带占96.2％。表明32个不同地理种源麻风树具有丰富的遗传多样性。 基于ISSR扩增条带数据建立了Jaccard遗传距离矩阵和聚类图。32个不同地理种源麻疯树间的遗传距离值为0.1081-0.4227，均值为0.2212。其中来自海南临高的种源与海南白沙的种源遗传距离最大，来自云南元阳城关的种源与云南元阳乌湾的种源遗传距离最小；32个不同地理种源麻疯树的聚类结果表明，云南的8个种源和四川的5个种源，以及贵州(除贵州册享的种源外)的7个种源，基本按地理来源各聚为一枝，表明其各自呈现与地理位置相对应较近的亲缘关系。而来自广西的8个种源，海南的3个种源，以及贵州册享的种源则与地理来源的相关性不甚明显，表明其相互间的亲缘关系相对较远。其中来自海南的3个种源不仅与来自其它省区的种源间存在较大的遗传距离，而且其两两间的遗传距离值高达0.3535-0.4247，表明海南种源与大陆地区种源间具有较远的亲缘关系，同时也表明海南地区种源间存在较大的遗传分化。
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