球蛋白二级结构含量预测及全新亲和配基设计初步

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中文摘要：蛋白质二级结构含量(α-螺旋含量、β-折叠含量)预测在蛋白质结构预测中扮演着一种重要的辅助角色.该文主要开发两种用氨基酸频率进行二级结构含量预测的新方法--改进的多元线性回归法(IMLR-1,IMLR-2法).该文两种方法的主要特色为:1.引进一个新的预测数据库-Chou数据库(K-C chou.Proteins:Struc Func Genet,1995,21:319-344);2.将蛋白质结构类作为预测输入信息;3.部分考虑不同氨基酸其频率的非线性项、耦合项.自检验结果和Jackknife检验结果表明该文两种方法平均预测误差相近且均小于0.05,这充分说明该文的两种预测方法具有很强的自适应能力和外推能力.与目前已开发的其它二级结构含量预测相比,该文的两种方法既简便可行,又能产生较高的预测精度.另外,该文还对目前有关分子模拟技术(包括分子力学方法、分子对接方法、配基设计方法等)进行概述;针对生物工程下游技术中一种非常有前途的蛋白质纯化方法中的亲和配基设计,提出运用分子模拟技术进行亲和配基设计或优化的思路,并对此作了初步探索,从而为进一步深入开展这方面工作打下了坚实的基础.从这部分的工作作者可以看到,分子模拟技术对分子化学工程来说将是一个非常有用的工具.

作者：

张子丁

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关键词：

蛋白质结构预测分子模拟 α-螺旋 β-折叠分子力学分子对接

授予学位：

硕士

学科专业：

化学工程

导师：

何志敏、张春霆

学位年度：

1997

学位授予单位：

天津大学

语种：

中文

中图分类号：