本研究针对小麦白粉病在育种和生产上面临着抗源单一化和抗病性容易丧失的严俊现状，建立了与两个小麦抗白粉病基因Pm12和Pm16紧密连锁的分子标记，为这两个基因的标记辅助选择奠定了基础： 1.抗白粉病基因Pm12的分子标记建立：抗白粉病性遗传分析结果表明，来自拟斯卑尔脱山羊草的Pm12抗白粉病基因为显性单基因控制。采用含有该基因的BC7F2分离群体进行SSR分析，结果发现EST-SSR引物Xcau108在抗白粉病株上有两条介于200-300bp的特异带，而在感病株上缺少此带，此标记位点暂定名为Xcau108/200-300。通过132个单株群体验证发现，该基因与Xcau108/200-300标记位点共分离。 2.抗白粉病基因Pm16的分子标记建立：抗白粉病性遗传分析结果显示，来自野生二粒小麦的Pm16抗白粉病基因由显性单基因控制。对含有该基因的BC6F3家系进行SSR分析发现，SSR引物cfd81在抗白粉病株和感病株具有扩增多态性，大小在200-300bp之间，该标记位点暂定名为Xcfd81/200-300。通过对206个单株的群体分析发现，有两个单株发生了交换，用软件MAPMAKER/EXP3.0分析，Xcfd81/200-300标记位点与Pm16的遗传距离为0.97cM。采用中国春缺体-四体和双端体系进行定位研究，结果显示，该位点位于5DS，并据此推断Pm16抗白粉病基因也位于5DS上。另外，还对Pm2、Pm16和Pm30基因进行了比较分析。
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