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猪HMGR基因的克隆、表达、染色体定位及多态性分析

王晓凤

猪HMGR基因的克隆、表达、染色体定位及多态性分析

王晓凤1
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作者信息

  • 1. 中国农业大学
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摘要

本文f通过RT-PCR和RACE技术首次获得了猪3-羟-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因全长cDNA序列,为2864bp(GenBank注册号为DQ432054),含有一个2658bp的完整开放阅读框、103bp的3’非翻译区和103bp的5’非翻译区。该基因编码885个氨基酸(GenBank注册号为ABD96089),相对分子量为97.15kDa,理论等电点为6.14,是一种可溶性的弱酸性球蛋白。用BLAST和ClustalW软件进行同源性分析,结果表明猪HMGR基因与人HMGR基因高度同源。在核苷酸水平上,猪HMGR基因与人的同源性为91%,与小鼠、大鼠和牛的同源性分别为85%、85%和91%。在氨基酸水平上,与人、小鼠、大鼠和牛的同源性分别为95%、92%、92%和96%。并进行了功能预测,结果表明猪HMGR蛋白是以a螺旋为主的a+β蛋白,含有一段由23个氨基酸残基组成的信号肽,预测到7个跨膜螺旋、1个固醇敏感结构域、1个HMGCoAREDUCTASE4结构域,同时也进行了翻译后修饰和活性位点预测。三级结构预测结果表明猪与人HMGR蛋白尽管在一级、二级结构上极为相似,但是在三级结构上表现出一些差异,这些差异是否会造成猪HMGR具有某些不同于人HMGR的功能尚需要实验加以证明。

关键词

猪基因序列/基因克隆/多态性分析

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授予学位

博士

学科专业

动物遗传育种与繁殖学

导师

王爱国

学位年度

2006

学位授予单位

中国农业大学

语种

中文

中图分类号

S8
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