摘要
根据已知大麦HinA基因的保守序列设计特异引物，对127份来自伊朗、以色列、土耳其共19个群体的野生大麦材料HinA基因进行克隆测序。分析了野生大麦19个群体HinA基因的SNP变异与生态因子之间的关系。同时，探讨了栽培大麦与野生大麦之间HinA基因的氨基酸类别和蛋白质二级结构差异。主要研究结果如下： 1．对19个群体127份野生大麦材料的HinA基因进行序列分析表明，HinA基因编码区和非编码区均具有丰富的SNP变异，平均每29．6个碱基一个SNP位点，且编码区碱基转换与颠换的比率为0．706：0．294，与多数大麦基因的置换比率基本一致（0．71：0．29）。在127份野生大麦材料的HinA基因编码区序列中共鉴定出15种单倍型，且单倍型在群体间较为分散。 2．野生大麦HinA基因的群体遗传多样性指数与Shannon信息指数的变化趋势是一致的，与群体的多态位点比例的大小趋势关系也大致相同。野生大麦HinA基因约2/3的遗传变异来源于群体内个体间，约1/3的遗传变异来源于群体间，而国家间遗传变异极小。野生大麦HinA基因在群体间存在着较为广泛的基因交流（Nm=3．31），同时产生了微小的遗传分化（Gst=0．0702），但是此基因在群体间的遗传距离与地理距离并不存在显著相关性（r=-0．005，p=0．478）。 3．通过斯皮尔曼等级相关分析发现，野生大麦群体内HinA基因的遗传变异与生态因子不存在显著性。只有以色列的野生大麦HinA基因的群体多样性，遗传多样性和Shannon信息指数与午后14时的平均湿度接近显著相关（p=0．071； p=0．052；p=0．052）。野生大麦HinA基因的SNP位点的遗传多态性与生态因子的斯皮尔曼等级相关关系结果显示，81．7%的SNP位点与生态因子之间存在显著相关关系，且同一位点与生态因子之间大都同时存在正相关和负相关。生态因子中影响SNP位点最多的是午后14时的平均湿度（25个），最少的是经度（11个），表明午后14时的平均湿度可能与HinA基因变异联系最为紧密，而经度对其影响最少。 4．通过MEGA3．1的Neighbor-Joining分析，野生大麦HinA基因的氨基酸序列分为两大类（类Ⅰ和类Ⅱ）。类Ⅱ又分为3个亚类Ⅱ-1、Ⅱ-2和Ⅱ-3。大部分HinA聚集在类Ⅰ和类Ⅱ-3中。146位点处氨基酸的差异可以明显区分栽培大麦和野生大麦，而71位点和78位点处的氨基酸差异可以明显区分开野生大麦类Ⅰ和类Ⅱ。根据氨基酸序列和蛋白质二级结构的分析，明确HinA含有3个α螺旋和5个β折叠，并且获得三处差异区域，分别为氨基酸30-40区、70-80区和140-150区。
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