摘要
本研究以国际芸薹属基因组计划（MBGP）已公布的509条白菜BAC的DNA序列为研究对象，搜索其中的SSR位点，开发了SSR分子标记，并以No．2127-17和ZY821的88个DH株系为作图群体，利用所开发的SSR标记构建了甘蓝型油菜油菜遗传连锁图，并将该图谱与白菜标准图谱进行了比较分析。主要结果如下： 1．对509条白菜“种子”BAC的DNA序列进行SSR位点搜索，共检出29，671个SSR。在509个白菜BAC中，单个BAC中搜索出的SSR数目在7-134之间。长度大于或等于20 bp的Ⅰ类SSR占13.2％，平均每15.5 kb有一个Ⅰ类SSR。长度在12 bp-20 bp之间的Ⅱ类SSR占86.8％，平均每2.4 kb有一个Ⅱ类SSR。这些SSR包括一至五核苷酸重复类型，其中，一至三核苷酸重复类型的SSR数目最多。单核苷酸重复中，（A）n的出现频率远大于（G）n。4种二核苷酸重复基元中，（AT）n出现频率最高，其次是（AG）n，（AC）n和（CG）n出现频率很低。在10种三核苷酸重复基元中，（AAG）n出现频率最高。四、五核苷酸重复基元种类多，分布散，出现频率均较低，其中（AAAN）n和（AAAAN）n出现频率显著高于其他重复基元。 2．在开发SSR标记时，为均匀覆盖白菜基因组，每个BAC只开发1-2个SSR标记，总共开发了788个SSR标记，命名为“BrGMS”。其中，二核苷酸重复类型数目最多，其次是三核苷酸重复类型。用6个甘蓝型油菜品种检测了788对BrGMS引物的扩增效率和多态性。其中有692对引物可以在两个以上的亲本中成功扩增，有357对引物在至少2个亲本间表现出多态性。四核苷酸重复类型SSR引物的扩增效率和多态性比例均为最高。不同重复基元SSR引物的扩增效率和多态性差异较大。二核苷酸重复基元中，（AC）n重复的扩增效率最高，（AG）n的多态性最高。三核苷酸重复基元中，扩增效率较高的是（AGG）n、（ATG）n和（AAG）n，GC含量丰富的重复基元扩增效率较低，但其多态性较高。 3．用150对在No．2127-17和ZY821间有多态性的BrGMS引物分析DH群体基因型，共检测到115个可统计的标记位点，另外用已发表的222对SSR引物在DH群体中检测到了294个标记位点。应用JoinMap3.0软件对这409个位点进行连锁分析，构建了一张包含19个连锁群、共329个位点（265个标记）的甘蓝型油莱遗传图，连锁图总长1731.6 cM，标记间平均图距为5.3 cM，不同连锁群长度变动范围在45.4 cM-187.5 cM之间，各连锁群上标记位点数介于5-39之间。 4．在定位的105个BrGMS标记位点，有85个位点分布在甘蓝型油菜的A基因组中，20个定位在C基因组中。根据BAC物理图可以推断出80个BrGMS标记所在染色体，其中大部分BrGMS标记定位在其BAC克隆来源的染色体上。将此连锁图与MBGP公布的白菜标准图谱进行了比较，A1-A10连锁群与白菜的A01-A10具有很好的同线性关系，A1-A10连锁群上大多数BrGMS标记的排列顺序与其来源白菜BAC克隆在相应白菜染色体上的排列顺序吻合较好。
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