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利用黑壳子粳/苏御糯重组自交系群体分析部分农艺性状的QTL

贾丰羽

利用黑壳子粳/苏御糯重组自交系群体分析部分农艺性状的QTL

贾丰羽1
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作者信息

  • 1. 南京农业大学
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摘要

水稻的许多重要农艺性状如株高、穗长、穗形、谷粒形态等都是数量性状,受多基因控制,在分离后代中表现为连续变异,受环境和遗传背景影响较大。随着分子标记连锁图的构建和遗传统计模型的发展,推动了水稻数量性状基因座的定位与克隆研究。 本研究利用162个家系组成的黑壳子粳/苏御糯重组自交系群体的分子图谱和表型鉴定,分析10个重要农艺性状的QTL。结果如下: 检测到3个来自苏御糯的粒长QTL。qGL1位于第1染色体RM1254-RM3652区间,贡献率为5.5%; qGL3位于第3染色体RM6959-RM6832区间,贡献率为29.2%,该区间与已经克隆的粒长基因GS3吻合;主效QTL qGL10位于第10染色体RM2125-RM8207区间,贡献率达30.9%,是一个新发现的粒长主效QTL。另外,检测到一个来自于黑壳子粳的粒宽QTL qGW8,位于第8染色体的SSR标记RM5353-RM3761区间,贡献率为7.8%。 检测到3个位于第4染色体的、来自黑壳子粳的颖壳颜色QTL。qGCl4.1位于RM16616-RM16973区间,贡献率为67.9%,LOD值11.47,是一个新的主效位点;qGCl4.2位于RM16973-RM3367区间,表型贡献率达68.9%, LOD值13.24,与已克隆的颖壳颜色基因Bh4处于相同区间;qGCl4.3位于RM241-RM6089区间,表型贡献率为17.7%,LOD值4.54。 检测1个位于第7染色体的、来自黑壳子粳的果皮颜色主效QTL qSCl7,位于RM180-RM5481区间,LOD值为12.79,表型贡献率为52.4%,与已克隆的果皮颜色控制基因Rc位点吻合。 检测到1个芒长QTL qAL11,位于第11染色体的RM3701-RM3428区间,其LOD峰值为2.53,QTL表型贡献率为7.6%,加性效应为0.451。 检测到1个来自于苏御糯的穗长QTL qEL3,位于第3染色体的RM3513-RM8277之间,其LOD值为2.79,表型贡献率为16.9%。检测到1个来自于苏御糯的影响穗抽出度QTL qPE7,位于第7染色体的RM336-RM51之间,LOD值为3.02,表型贡献率为8.2%。 检测到1个株高QTL qPH6,位于第6染色体长臂末端的SSR标记RM7561-RM190之间,其LOD峰值为2.63,表型贡献率为12.07%,加性效应为-6.962,增高效应来自于苏御糯。检测到1个控制剑叶宽的QTL qFW6,位于第6染色体的标记RM3567-RM454之间,LOD值为3.12,解释9.62%的表型变异。

关键词

水稻/重组自交系/农艺性状/遗传统计模型

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授予学位

硕士

学科专业

作物

导师

王建飞

学位年度

2012

学位授予单位

南京农业大学

语种

中文

中图分类号

S5
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