摘要
苦荞是一种二倍体一年生作物,广泛种植于亚洲、欧洲。苦荞可在高海拔地区种植,生长期短,种子蛋白含量高,在我国部分山区及北半球一些国家是重要的粮食作物。苦荞的氨基酸含量均衡,含有芦丁、槲皮素、山奈醇-3-芸香糖苷等黄酮类药用成分。苦荞大多种植于贫瘠的土地上,产量不高,通过分子标记辅助育种方法提高其抗逆性,改良品质及产量是苦荞产业化发展的重要课题。 遗传图谱的构建是分子标记辅助育种的基础,同时也是植物基因组研究的重要内容之一。对于具有重要经济价值的苦荞来说,构建遗传图谱可用于优良基因和重要农艺性状定位、分子标记辅助育种,意义重大。 本研究以滇宁一号(母本)与野苦荞(父本)的136株F2代为作图群体,利用两种分子标记,对适用于苦荞的SRAP和SSR反应体系的建立以及标记的分离分析等方面进行了研究,并构建出目前第一张苦荞分子遗传连锁图谱。具体研究内容如下: 采用交互正交设计L27(313)对苦荞SRAP-PCR、SSR-PCR反应体系进行了5因素(Mg2+、dNTP、Taq酶、模板DNA和引物)3水平优化实验,并进行了验证,最佳SRAP-PCR反应体系为:总体积20μl,Mg2+1.5mmol/L,dNTP0.2mmol/L,Taq酶1.5U,模板DNA40ng,引物0.25μmol/L,10×buffer2μl;最佳SSR-PCR反应体系为:总体积20μl,Mg2+1mmol/L,dNTP0.3mmol/L,Taq酶1.5U,模板DNA30ng,引物0.25μmol/L,10×buffer2μl。 将扩增产物进行非变性与变性PAGE和两种电泳操作系统检测,结果表明,非变性PAGE、DYCZ-24F操作系统更适合于SRAP的分析。 利用165对SRAP引物扩增亲本及杂交F1代DNA,筛选到多态性引物43对,多态性比例为26.1%。用43对多态性引物对F2群体进行分析,共获得多态性标记50个,其中引物M1E2、M3E3、M6E19、M10E4、M11E17分别产生两条多态性标记;引物M1E6产生3条多态性标记。经卡方测验,获得的50个多态性标记中,有35个(70%)SRAP标记符合孟德尔分离比例。从148对SSR引物中筛选到多态性引物26对,多态性比例为17.6%。用26对多态性引物对F2群体进行分析,只有一对引物标记无偏分离现象,其它25对全部偏于母本。 利用Mapmaker/EXP3.0软件构建了包含10个连锁群,由37个SRAP标记、1个SSR标记组成的遗传连锁图谱。该图谱总长725.1cM,标记间最大图距为46.6cM,最小图距为2.2cM,平均图距为25.9cM;连锁群上的标记数在2-6个之间,LG4、LG6包含的标记最多,均为6个;LG3、LG8、LG9包含的标记数最少,为两个。 本论文构建的苦荞遗传连锁图谱,优点是标记在图谱上清晰、特异扩增、重复性好;缺点是标记少、密度低,需要进一步利用SRAP标记进行加密,建立较完整的苦荞分子遗传连锁图谱。