摘要
爱德华氏菌(Edwardsiella)是一类导致世界范围内鱼类养殖业重大经济损失的病原菌。然而,目前关于它的分类仍存在一定争议,这将阻碍对它的流行机制的更深入理解和更为高效的疫苗的开发。当前,爱德华氏菌主要被分为三个种:迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda),鲶鱼爱德华氏菌(Edwardsiella ictaluri)和保科爱德华氏菌(Edwardsiella hoshinae)。 本课题组之前的系统发育研究表明,可以根据基因组型将爱德华氏菌分为两类,EdwGⅠ和EdwGⅡ。EdwGⅠ主要包括对鱼类致病的迟钝爱德华氏菌菌株,这类菌目前被建议改名为杀鱼爱德华氏菌(Edwardsiella piscicida)。 本课题通过基因组及多种系统分类方法,将杀鱼爱德华氏菌中分离自鳗鲡体内的部分菌株独立出来,重新命名为鳗鲡爱德华氏菌(Edwardsiella anguillarum),模式菌株为ET080813T(=DSM27202T=CCUG64215T=CCTCC AB2013118T=MCCC1K00238T)。通过多位点序列分析,ET080813T和其他爱德华氏菌相似度在82.99~95.38%。对ET080813T和其他爱德华氏菌进行DDH模拟计算,数值在24.4~60.1%。根据基因组数据,其GC含量在58.72%。其呼吸醌为甲基萘醌(MK-8),脂类成分为磷脂酰乙醇胺脂、磷脂酰甘油、氨脂质、磷脂和一种未知的脂类。进一步比较基因组学表明,鳗鲡爱德华氏菌获得了肠上皮细胞损伤基因座(LEE),并至少携带有2套三型分泌系统(T3SS)和3套六型分泌系统(T6SS)相关基因簇。这些发现将有助于针对鱼类爱德华氏菌病的菌种特异性防治,同时揭示关于爱德华氏菌毒力进化机制的研究。