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新疆维吾尔族及汉族乙型肝炎病毒感染与HLA-DP单核苷酸多态性的相关性研究

郭宇璇

新疆维吾尔族及汉族乙型肝炎病毒感染与HLA-DP单核苷酸多态性的相关性研究

郭宇璇1
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作者信息

  • 1. 新疆医科大学
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摘要

目的:通过检测候选基因HLA-DP rs3077、rs2301220、rs3135021、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471八个位点单核苷酸多态性,探讨新疆维吾尔族、汉族HLA-DP SNPs与慢性乙型肝炎病毒感染的相关性;探讨HLA-DP基因单核苷酸多态性是否影响维、汉两民族之间 HBV感染的个体差异。为临床诊断、治疗及预后提供以分子学水平为指标的遗传学参考依据。 方法:收集新疆医科大学中医医院、库尔勒维吾尔医院的住院和门诊患者以及体检人员作为受试者。所收样本分为维族、汉族慢性乙肝患者;维族、汉族健康者共四组,每组人数均等。采用1:1病例-对照研究,病例组为慢性乙肝患者,对照组为体检健康人群。1、使用DNA提取试剂盒提取标本基因组DNA并进行质检。2、用SNapshot方法对HLA-DP基因rs3077、rs2301220、rs3135021、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471的八个位点进行检测及分型。3、统计分析采用SAS9.3。研究中所获得的数据,年龄采用均数和标准差表示,基因型频率和等位基因频率采用构成比或绝对数描述,先对维吾尔族与汉族之间进行 Hardy-Weinberg平衡检验,乙肝组和非乙肝组之间基因多态性的差异采用χ2检验,分别以疾病、性别作为分层因素比较汉族和维吾尔族之间、乙肝非乙肝之间基因多态性的差异采用Cochran-Mantel-Haenselχ2检验,不同基因型和有无乙肝之间的多因素分析采用Logistic回归,检验水准α=0.05,1-β=0.8。 结果:1、在 HBV+组和健康对照组比较中 rs3077(χ2=8.323,P=0.0156)、rs2301220(χ2=9.470, P=0.0088)、rs9277341(χ2=11.923, P=0.0026)这三个位点的P值均小于0.05,具有统计学意义,故其位点多态性与HBV感染相关。2、在汉族HBV+与对照组比较时,rs3077(χ2汉HBV vs对照=9.313, P=0.0095)、rs2301220(χ2汉HBV vs对照=9.566, P=0.0084)、rs9277341(χ2汉HBV vs对照=13.096, P=0.0014)三个位点的P值均小于0.05,具有统计学意义。3、在汉族健康对照组与维吾尔族健康对照组比较,rs3077(χ2对照汉vs维=28.096, P<0.0001、rs2301220(χ2对照汉vs维=21.637, P<0.0001)、rs9277341(χ2对照汉vs维=24.467, P<0.0001)、rs9277378(χ2对照汉vs维=16.695, P=0.0002)、rs9277471(χ2对照汉vs维=14.946, P=0.0006)、rs9277542(χ2对照汉vs维=16.074P=0.0003)、rs9277535(χ2对照汉vs维=18.645,P<0.0001)这七个位点的单碱基分型具有统计学意义。4、汉族 HBV+和维吾尔族 HBV+比较,rs3077(χ2HBV汉vs维=45.675, P<0.0001)、rs2301220(χ2HBV汉vs维=38.934, P<0.0001)、rs9277341(χ2HBV汉vs维=47.344, P<0.0001)、rs9277378(χ2HBV汉vs维=26.661, P<0.0001)、rs9277542(χ2HBV汉vs维=24.309, P<0.0001)、rs9277471(χ2HBV汉vs维=29.360, P<0.0001χ2对照汉vs维)这六个位点中单核苷酸多态性分型具有统计学意义。5、在性别与乙型肝炎病毒感染的相关性研究中发现健康对照组rs9277341(χ2对照男vs女=9.271, P=0.0097)、rs9277378、(χ2对照男vs女=7.936, P=0.0189)、rs9277542(χ2对照男vs女=8.364, P=0.0153)、rs9277471(χ2对照男vs女=8.194, P=0.0166)四个位点的单碱基分型是具有统计学意义的。 结论:1、HLA-DP SNP与乙型肝炎病毒感染的关系,rs3077、rs2301220、rs9277341的三个位点与乙型肝炎病毒感染相关,其中 rs3077GG、rs2301220TT、rs9277341CC基因型可能增加乙型肝炎感染的风险。2、汉族健康对照组和维吾尔族健康对照组比较,发现 rs3077、rs2301220、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277471这六个基因位点具有统计学意义。其中rs3077AA、rs2301220CC、rs9277341TT、rs9277378AA、rs9277542TT、rs9277471GG基因型有可能降低乙型肝炎病毒感染的可能性。3、男女性别差异与乙肝病毒感染的关系,rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277471四个位点可能与发病人群中的那女性别差异相关。rs9277341CC、rs9277378GA、rs9277378GG、rs9277542CC基因型有可能增加乙型肝炎感染的风险。4、HLA-DP基因的基因频率是存在民族差异的,HLA-DP基因的rs3077、rs2301220、rs9277341、rs9277378、rs9277542、rs9277535、rs9277471的七个位点中不同基因A、G、C、T的数目和基因频率在维吾尔族与汉族中存在显著差异,而 rs3135021的两种等位基因A、G的数目和频率在两民族之间无统计学意义。

关键词

慢性乙型肝炎/单核苷酸多态性/病毒感染/民族差异/遗传学

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授予学位

硕士

学科专业

临床检验诊断学

导师

徐菲莉

学位年度

2014

学位授予单位

新疆医科大学

语种

中文

中图分类号

R5
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