分子标记辅助选择(marker assisted selection, MAS)糅合传统育种方法,在动物遗传育种过程中得到了广泛应用。这种方法使得猪遗传改良的进程加快,在猪育种工作中占据愈加重要的作用。寻找并选择与猪的生产或繁殖性状相关的主效基因,是分子标记辅助选择的基础。本研究选取了 NAD+依赖性去乙酰酶沉默信息调节因子-2(NAD+-dependent deacetylase sirtuin-2, Sirt2)、过氧化物酶体增殖物激活受体δ(Peroxisome proliferator activated receptorsδ, PPARδ)、花斑抑制因子同源物1/2(suppressor of variegation3-9 homolog1/2, Suv39h1/2)个候选基因进行了研究。实验中,以猪毛囊为试验材料提取了537份长白猪、50份约克夏基因组DNA,另有实验室保存的36份杜洛克猪、24份嵊县花猪和50份嘉兴黑猪的基因组DNA,设计引物,通过 PCR扩增得到各个基因位于外显子的部分序列,测序比对筛选各基因SNPs并对其等位基因频率和基因型频率以及 Hardy-Weinberg平衡状态做了分析。对537只长白猪中得到的SNPs与部分生产性状进行关联分析。 获得结果如下: 1. Sirt2基因的表达产物为一种保守的 NAD+依赖性去乙酰酶沉默信息调节因子,试验中于目的片段测序区共得到4个SNPs:59A/C、303A/G、350C/G和488A/G。测序峰图显示每个SNP处都有三种基因型,分别命名为AA、AB、BB、CC、CD、DD、EE、EF、FF、GG、GH和HH。卡方检验表明,59A/C和303A/G两个基因座均处于Hardy-Weinberg平衡状态,350C/G、488A/G显著偏离平衡状态。59A/C和303A/G六种基因型与长白猪生产性状关联分析结果表明,AA型个体初生重显著高于AB和 BB型个体(P<0.05);DD型个体平均日增重极显著高于 CD型个体(P<0.01),显著优于CC型个体(P<0.05)。 2. PPARδ基因的表达产物过氧化物酶体增殖物激活受体是核激素受体超家族成员,试验中于目的片段测序区共得到1个SNP:69586A/G,测序峰图显示三种基因型,分别命名为II、IJ和JJ。卡方检验表明,此位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态,性状关联分析结果显示,JJ型个体背膘厚显著优于II、IJ型个体(P<0.05)。 3. Suv39h1基因的表达产物是组蛋白甲基化转移酶家族的一个成员,试验中于目的片段测序区得到2处SNPs:655A/G、920C/T,测序峰图显示六种基因型,分别命名为 KK、KL、LL、MM、MN和 NN。卡方检验表明,两位点均极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态,性状关联分析结果显示,KK、KL和LL型个体之间均无显著差异;MM型个体100 kg日龄显著低于MN、NN型个体(P<0.05)。 4. Suv39h2基因是组蛋白甲基化转移酶家族的一个成员,试验中目的片段测序区得到1个SNPs:23301C/G,测序峰图显示三种基因型,分别命名为OO、OP和PP。卡方检验表明,此位点极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态;性状关联分析结果显示,OP型个体断奶重显著优于OO、PP型个体(P<0.05)。
NETL
