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hTERT rs2736098基因多态性与肝外胆管癌易感性关系的研究

刘鹏

hTERT rs2736098基因多态性与肝外胆管癌易感性关系的研究

刘鹏1
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作者信息

  • 1. 中国医科大学
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摘要

目的:探讨端粒酶逆转录酶(TERT)基因位点rs2736098多态性与中国人群肝外胆管癌易感性之间的关系,寻找影响胆管癌发病的基因位点。 方法:研究对象为北方地区汉族人群,并且相互之间无血缘关系。经过中国医科大学附属盛京医院伦理委员会同意,并获取了所有患者的知情同意后,留取外周血标本,同时完成流行病学调查。采用病例对照原则,病例组200名来自中国医科大学附属盛京医院,有明确病理诊断或临床诊断的新发肝外胆管癌患者,既往无肿瘤病史,无放化疗病史。对照组200名来自同期中国医科大学附属盛京医院体检中心的健康人群。所有病例和对照均在2012年9月至2014年12月期间收集,同时收集参与者的流行病学信息。 所有参与研究的个体外周血标本采集使用枸橼酸钠抗凝试管,每人采血约2ml,用酚-氯仿法提取基因组DNA。采用Taqman real-time PCR方法及SDS(美国应用生物系统公司)软件程序进行单核苷酸多态性的基因分型。在每个96孔检测单元中分别设立阴性对照和重复标本作为质量控制;阴性对照中不加模板DNA,而以双蒸水代替,用于检验是否存在PCR污染。每个SNP的信号强度需在两个尺度上满足形成三个明显的簇,随机选择10%的样本进行盲法重复测量。PCR反应体系共5μl,包括2X Taqman Master Mix2.5μl,20X引物与探针混合物0.25μl,H201.25μl,DNA1.00μl。PCR扩增:95℃预变性10min;92℃变性30秒,60℃退火以及延伸1分钟;共47个循环。以SDS(美国应用生物系统公司)软件Allelic Discrimination程序进行终点分析,判断待测样本的多态性基因型。利用SPSS19.0软件进行数据整理分析,所有的统计检验均以P<0.05为有统计学显著性差异。 以x2检验比较人口学特征、相关危险因素暴露及SNPs基因型在病例与对照之间分布的差异;以拟合优度x2检验对照的Hardy-Weinberg分布平衡情况;以单因素和多因素logistic回归计算比值比(odds ratio,OR)及95%可信区间(confidenceinterval,CI)。 结果:TERT基因位点rs2736098多态性与胆管癌易感性:所有病例调整年龄和吸烟状态后,发现携带有TERT基因rs2736098位点T/T基因型的人比携带有C/C基因型的人患胆管癌的风险明显升高(P=0.01 OR=1.33),合并C/T、T/T后仍有统计学差异(P=0.016,OR=4.28); 结论:1、发现hTERT基因rs2736098位点多态性与胆管癌易感性相关,其携带T等位基因增加了胆管癌的发病风险。

关键词

胆管癌/端粒酶逆转录酶/单核苷酸多态性/遗传易感性

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授予学位

硕士

学科专业

临床医学;外科学

导师

王鹤令

学位年度

2015

学位授予单位

中国医科大学

语种

中文

中图分类号

R73
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