猪THRSP基因启动子变异对THRSP表达及其靶基因转录水平的影响

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中文摘要：THRSP基因作为甲状腺素受体调控和激活转录因子，参与调控了多种在脂肪合成途径中起到调节作用的酶类，在组织特异的脂类代谢调控中起重要作用。本文以三元杂交猪（杜洛克×[大白×长白]）为研究对象，通过对样本猪肝脏THRSP调控区SNP检测，多态片段基因型鉴定，分析不同启动子基因型(A组、D组、F组)调控脂肪合成途径中相关酶的基因转录及其影响。采用RNA-Seq和荧光定量PCR方法，检测THRSP及候选靶基因在不同基因型猪肝脏组织中的表达差异。结果表明：（1）THRSP基因启动子区5个突变位点分别是位于CDS上游的A-95T、G-98A、A-376G、T-400C和C-459T，分别构成3种启动子基因型CCTTGGGGAA（A组）、CCCCAAAATT（D组）和CCTCGAGAAT（F组）。（2）A组猪的THRSP基因表达水平显著高于D组，显示为上调(P<0.05)，杂合子F组的表达则介于两者之间，表现中间型表达水平，并且THRSP表达水平显示为A>F>D组(P<0.05)；（3）qPCR检测显示，候选靶基因mRNA的表达丰度也存在显著差异，其中候选靶基因苹果酸酶1（ME1）、柠檬酸裂合酶(ACL)、脂肪酸合酶(FASN)和磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶(PEPCK)的mRNA表达量均以A组最高，D和F组两组差异不显著；（4）RNA-Seq结果显示THRSP表达水平对苹果酸酶3（ME3）和FASN的转录水平影响达到显著水平（P<0.05），其中高水平组（A组）的THRSP能显著上调ME3和FASN的转录水平，但THRSP的3种转录水平对PEPCK1、PEPCK2和ACL的mRNA表达量均未能造成明显的影响（p>0.05）。

作者：

胡利影

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关键词：

杂交猪 THRSP基因启动子变异苹果酸酶3 脂肪酸合酶

授予学位：

硕士

学科专业：

养殖

导师：

陈宏权

学位年度：

2016

学位授予单位：

安徽农业大学

语种：

中文

中图分类号：