摘要
KTM3315A属于非1B/1R类型的K型小麦雄性不育系,具有粘果山羊草的细胞质背景,含有莫迦小麦1BS染色体上的T型育性恢复基因Rf3和K型育性恢复基因rfv1,其育性具有生态敏感性,属YM型小麦温敏细胞质雄性不育系,在小麦两系杂交育种中具有一定的应用潜力,已有学者对其形态及生理做出相关研究,但是其育性转换的分子机制仍然尚待研究。本实验的目的在于通过多方面分析验证,初步揭示KTM3315A的育性转换分子机理,为更有效地利用和改善KTM3315A提供理论依据,也期望为小麦温敏雄性不育系的研究有所贡献。 本实验利用在不同温度条件下的不育系KTM3315A在育性转换关键时期的花药进行lncRNA测序分析,旨在通过生物信息学分析差异表达mRNA,对其进行功能富集分析,确定育性转换的候选基因和关键代谢通路;并通过分析lncRNA的测序结果,对lncRNA的靶基因进行预测,根据靶基因差异表达情况进行生物信息学分析,推测lncRNA调控育性转换的作用机制;除此之外还对三个发育时期的育性转换相关基因进行了qRT-PCR测定。获得以下研究结果: 1、完成6个样品的长链非编码RNA测序,共获得72.72Gb Clean Data,平均每个样品的Clean Data达到10.81Gb,Q30碱基百分比在95.52%及以上。分别将各样品的Clean Reads与指定的小麦参考基因组进行序列比对,比对效率从65.85%到70.51%不等。根据基因在不同样品中的表达情况,识别差异表达基因16,839个,并分别对每个时期的差异表达基因进行功能注释和富集分析,结果显示差异表达基因的COG功能分类主要富集到碳水化合物和氨基酸的转运和代谢,KEGG代谢途径主要富集到淀粉蔗糖代谢和苯丙烷生物合成通路,为育性转换机制的进一步研究奠定了基础。 2、通过分析差异表达基因中的转录因子(MYB、ER、HS、bHLH、WRKY、MAD-box、NAC、GLK2和GATA等),发现MYB转录因子的所占比例最高(15%),并通过参与茉莉酸和苯丙烷生物合成途径调控育性转换。说明在可育条件下MYB转录因子可能与茉莉酸和苯丙烷生物合成途径相互作用,通过促进苯丙烷途径中关键酶的上调表达,保证了花粉外壁的顺利合成,从而使得KTM3315A可育。 3、通过表达模式筛选,得到一个长链非编码候选基因lncRNA-TaPCF,该基因正向调控两个锌指蛋白,从而促进光合作用碳固定途径中关键酶的上调表达,保证了可溶性糖和淀粉以及蛋白质的顺利合成,因此推测高温条件下的KTM3315A能够保证花药发育所需物质的合成。 4、经荧光定量PCR测定发现,差异表达基因的定量结果与测序结果吻合。这证明lncRNA测序具有良好的的稳定性和重复性,也证实了在KTM3315A的育性转换过程中会伴随着育性转换相关基因的表达量的变化。基因定量验证为后续转基因验证方面提供更可靠的理论支撑。